1.鱼类疫病
中华人民共和国农业部公告第96号《一、二、三类动物疫病病种名录》列为二类动物疫病的水生动物疫病有：病毒性出血性败血病、鲤春病毒血症、对虾杆状病毒病。三类动物疫病规定鱼病：鱼传染性造血器官坏死、鱼鳃霉病。
病毒性出血性败血病是由弹状病毒科的病毒性出血性败血病病毒引起的虹鳟的一种急性败血性传染病。其特征是鱼体发黑、眼球突出、鳃、鳍条、肌肉和内脏出血。
鲤春病毒血症是由弹状病毒引起的鲤鱼的一种急性传染病。其特征是体黑眼突、皮肤出血、肛门红肿、腹胀、肠炎。
对虾杆状病毒是由对虾杆状病毒引起的一种急性高度致死性传染病。其特征为肝、胰腺或中肠上皮的细胞核内有大量的四面体包涵体，幼虾发病率和病死率均很高，病程短。鱼传染性造血器官坏死是由弹状病毒科水泡性病毒属的弹状病毒引起的鲑、鳟鱼类的一种急性传染病，死亡率很高。病鱼体色暗黑，肛门通常拖着一条半透明的粪便，也是该病的一个特征；腹部有腹水且肿胀，眼球突出，贫血，鳃显著褪色。从胸鳍基部、背部一直到前胸部以及肛门附近的躯干肌肉常有出血现象，口腔壁也有出血点。具有卵黄的仔鱼卵黄囊出血，内充满浆液而肿胀。
鱼鳃霉病也叫青疽病，是由鳃霉菌引起的一种急性传染性真菌病。其特征为鳃组织破坏且严重贫血。病鱼鳃瓣失去正常鲜红而呈粉红或苍白色。随着病情发展，菌丝不断向鳃组织里生长，破坏了鳃组织，堵塞血管，呼吸机能受到了严重阻塞。从病原体寄生起，如条件适宜， 1-2天内即大量繁殖，
出现暴发性的大批死亡。
2.鱼的临床诊断检疫
活鱼的检查通常以视诊为主，先观察鱼的群体状况，再捞出可疑病鱼3-5条，检查其体表、眼睛、鳃、鳞片、肛门等部位状态，再将病鱼解剖，检查内脏状况。必要时，送实验室确诊。
病鱼特征：离群独游，反应迟钝，或急躁不安或跳出水面，或打转、浮沉困难，或颠倒浮游。食欲不振，发育异常，失去健康鱼的正常体表特征，体色发黑或出血发红。眼球突出，鳃盖张开，鳃丝发黑或苍白或有出血点、末端肿大或腐烂、粘液增多不洁，有的鳍条基部充血或出血、鳍条裂开。肛门红肿，肚腹膨胀，有的排管状粘液或肛门拖带粪便。有时可在体表或其他部位发现寄生虫。
3.处理方法
若检出病毒性出血性败血病、鲤春病毒血症病、鱼传染性造血器官坏死病时，应立即进行隔离处理。死鱼深埋，不得 乱弃。用过的用具应消毒，病鱼不得外运销售。
若检出对虾杆病毒病时，对病死虾均应深埋或销毁，虾塘彻底消毒，禁止病对虾上市销售，暂停虾种调出。
若检出鱼鳃霉病时，应迅速加入清水，或将鱼迁移到水若检出对虾杆状病毒病时，对病死虾均应深埋或销毁，质较好的池塘或流动的水中。用生石灰清塘。其他处理方法虾塘彻底消毒，禁止病对虾上市销售，暂停虾种调出。与病毒性出血性败血病相同。