雷蒙德氏棉DNase Ⅰ高敏感位点(DHSs)文库构建方法
摘要:
染色质DNA对DNase Ⅰ表现出高敏感性的位点(DNase Ⅰ hypersensitive sites,DHSs)多是顺式作用元件所在的位置,包括启动子、增强子、调节子和衰减子等.研究DHSs位点的数目及其动态变化是探明顺式作用元件功能、揭示基因表达调控机制,乃至进行基因编辑和创新遗传材料的重要辅助手段.本文借鉴水稻和拟南芥DHSs文库构建方法,通过优化设计,初步建立了二倍体雷蒙德氏棉(Gossypium raimondii D5)的DHSs文库,为深入进行棉花功能基因组研究奠定基础.
DNase I hypersensitive sites(DHSs)usually are locations of the cis-regulatory elements on chromatin,such as promotors,enhancers,regulators and attenuators.Study on the number and dynamic changes of DHSs among the whole genome is an important auxiliary means to understand the function of cis-regulatory elements,reveal gene expression regulation mechanism,and even create new genetic material using genetic editing.Based on the construction of DHSs library in rice and Arabidopsis thaliana,DHSs library construction about diploid cotton Gossypium raimondii(D 5)was established,which will lay the foundation for further research on functional genomics in cotton.
作者:
王惠敏 刘玉玲 韦洋洋 张树林 刘震 卢全伟 杨太有 彭仁海
Wang Huimin;Liu Yuling;Wei Yangyang;Zhang Shulin;Liu Zhen;Lu Quanwei;Yang Taiyou;Peng Renhai(College of Life Sciences,Henan Normal University,Xinxiang 453007,China;College of Biology and Food Engineering,Anyang Institute of Technology,Anyang 455000,China)
机构地区:
betway官方app 生命科学学院 安阳工学院生物与食品工程学院
出处:
《betway官方app 学报:自然科学版》 CAS 北大核心 2018年第3期101-105,共5页
基金:
国家自然科学基金(31471548) 河南省科技创新杰出人才(2018JR0009) 棉花生物学国家重点实验室开放课题(CB2017A06) 河南省高等学校重点科研项目(18A180010).
关键词:
雷蒙德氏棉 DNaseI高敏感位点(DHSs) 顺式作用元件 文库构建
Gossypium raimondii DNase I hypersensitive sites(DHSs) cis-regulatory elements library construction
分类号:
Q756 [生物学—分子生物学]